Особо охраняемыми природными территориями являются: биосферные заповедники Сьерра-дель-Росарио и Гуанаакабибес в провинции Пинар-дель-Рио; заповедник Сан-Фелипе (Лос-Индиос) и морской парк Пунта-Франсес на острове Хувентуд; национальный парк Варадеро; природные парки Бахиа-де-Наранхо и Ла-Менсура и Баконао в провинции Ольгин; национальный парк Сьерра-Маэстра в провинцип Сантьяго-де-Куба и парк «Александр Гумбольдт» в провинции Гуантанамо; заповедники Эль-Кабо, Купелль и другие.
Западный район
Отличается мозаичностью геологического строения и рельефа, наибольшим проявлением тропического карста. Располагает крупными ресурсами подземных вод. Естественные ландшафты почти полностью заменены сельскохозяйственными угодьями и городской застройкой.
Животный мир Кубы вследствие ее островного положения довольно беден. Кроме того, он сильно пострадал в результате хозяйственной деятельности человека.
До начала колонизации леса покрывали более 50 % территории, ныне — лишь около 10 %, главным образом в горных и заболоченных районах. Благодаря ровному климату и плодородным почвам на Кубе произрастает более 3000 видов тропических плодовых растений и цветов.
Реки Кубы (их насчитывается около 200) в большинстве коротки и немноговодны и не имеют большого хозяйственного значения. Они растекаются от главного водораздела, совпадающего с осевой частью острова. Питание рек преимущественно дождевое. Колебания их уровня соответствуют режиму осадков.
Климат Кубы — тропический, пассатный. Среднегодовая температура составляет 25,5 °C. Средняя температура самого холодного месяца (январь) равна 22,5 °C и самого жаркого (август) — 27,8 °C. Температура поверхностных вод у берегов зимой составляет 22-24 °, летом — 28-30 °C. Среднегодовое количество осадков, выпадающих обычно в виде ливней — 1400 мм, однако нередко случаются и засушливые годы.
Куба занимает одно из ведущих мест в мире по добыче никеля (2-е место в мире по запасам и 3-е — по производству), обладает значительными запасами хрома, марганцевых, железных и медных руд, асбеста, каменной соли, фосфоритов.На западе страны открыты месторождения нефти и газа.
Куба представляет собой мегантиклинорий, который входит в Антильско-Карибскую область складчатого геосинклинального пояса Кордильер. В альпийской структуре о. Куба выделяются 2 структурных этажа: нижний — геосинклинальный (верхнеюрский — среднеэоценовый) и верхний — орогенный, породы которого имеют возраст от олигоцена до современной эпохи включительно.
Рельеф Кубы преимущественно равнинный. Возвышенности и горы занимают около трети территории. Самый высокий горный массив Сьерра–Маэстра протянулся вдоль юго-восточного побережья на 250 км. Его высшая точка — пик Туркино (1974 м). Расположенные на западе острова живописные невысокие горы причудливо рассечены и слабо заселены.
Более 600 000 гектаров занимает самая большая на Кубе охраняемая территория Сапата, имеющая статус водно-болотного угодья международного значения, который был ему присвоен главным образом из-за водоплавающим птиц. Здесь же обитают более 3000 кубинских крокодилов – крупнейшая популяция находящихся под угрозой исчезновения пресмыкающихся.
На Кубе - крупнейшая в Западном полушарии колония карибских фламинго. Здесь гнездится около семидесяти тысяч этих великолепных птиц. По соседству, на холмике, фламинго склонился к своему птенцу, чтобы накормить его. На еду фламинго смотрят снизу вверх: птица разворачивает голову так, что нижняя часть клюва оказывается наверху. Нижняя челюсть служит поплавком, благодаря ей клюв не погружается слишком глубоко.
Остров Куба расположен на достаточном удалении от материка и имеет уникальный растительный и животный мир. На Кубе произрастает более 6000 видов растений, причем половина из них — эндемики.